Gunakan Teknologi Oxford Nanopore, LIPI Sukses Teliti Sekuens COVID-19

LIPI
LIPI
LIPI
LIPI (Istimewa)

OBATDIGITAL – Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI) berhasil mengurutkan sekuens genom utuh atau Whole Genome Sequencing (WGS) dua sampel virusSARS-CoV-2 penyebabCOVID-19 dari Indonesia. Riset ini menggunakan teknologi Oxford Nanopore, inggris, dengan mengambil spesimen kasus positif pada Agustus 2020.

Kepala Laboratorium Biosafety Level-3 Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI Ratih Asmana Ningrum menuturkan, terdapat proses untuk membandingkan hasil sekuensnya.

Ia mengamati mutasi sekuens virus yang telah dikirim beberapa bulan sebelumnya. Dari sinilah diketahui tipe virus yang ada di Indonesia dan sejauh mana perubahan yang terjadi.

“Dari sekuens genom juga dapat dipelajari asal muasal virus, bagaimana dapat tersebar, apakah dari transmisi lokal atau tidak, dan lain-lain,” ujarnya kepada CNNIndonesia.com, Minggu (30/8/2020).

Meski telah ditemukan adanya mutasi pada 12 sekuens SARS-CoV-2, tetapi LIPI belum dapat memastikan apakah mutase itu akan berpengaruh terhadap tingkat infeksi virus. Ratih menegaskan masih diperlukan pengolahan data bertahap sehingga dapat diperoleh urutan genom lengkap dari suatu organisme.

“Namun, penggunaan platform ini masih sangat terbatas. Salah satu faktor pembatasnya adalah kurangnya sumber daya manusia yang terampil dalam menggunakan teknologi tersebut,” ujarnya.

Apabila kendala tersebut dapat teratasi, maka Oxford Nanopore mampu mempermudah riset lanjutan mengenai COVID-19. Selain cara kerja alat ini yang lebih cepat dan fleksibel, harga instrumen juga tergolong terjangkau.